首届国际水动力学学术会议（1994，无锡）
由《水动力学研究与进展》编委会联合中国造船工程学会、中国水利学会、中国海洋学会、日本土木工程师学会、美国土木工程学会主办的第一届国际水动力学学术会议（ICHD-94）于1994年10月30日至11月3日在无锡召开。参加会议的有正式代表115人，其中国外代表61人（含夫人12人），国内代表54人。列席旁听代表30人。参加会议的主要国家和地区有：美国（10人）、日本（13人）、韩国（13人）、德国（4人）、荷兰（4人）、香港（4人）、澳大利亚（2人）、意大利（3人）、以色列（2人）比利时（1人）、法国（1人）、挪威（1人）、新加坡（1人）、伊朗（1人）、中国台湾（1人）。大会报告和分会报告有美国麻省理工学院著名华裔学者、美国工程科学院院士梅强中教授、挪威特隆赫姆大学著名学者福尔廷森（O.Faltinsen）教授、日本横滨大学著名学者合田良实（Y.Goda）、中国船舶科学研究中心所长、中国工程院院士吴有生教授等的大会邀请报告4篇，美国、日本、韩国、荷兰、香港、澳大利亚、中国等国际著名水动力学专家的分会邀请报告10篇，还有交流论文88篇。
首届全球华人水动力学学术会议（2006，上海）
为了庆祝《水动力学研究与进展》创刊20周年，进一步弘扬中华民族文化、促进水动力学跨学科的交叉学术交流，为全球华人水动力学科的科研人员提供发表最新研究成果和交换研究信息平台，《水动力学研究与进展》编委会、中国力学学会、中国造船工程学会、中国水利学会、中国海洋学会、上海力学学会于2006年7月11–14日在上海召开了全球华人水动力学学术会议（CCSH’06），到会的有来自13个国家和地区的华人学者和专家120人。著名美籍华人学者美国工程院院士梅强中教授和刘立方教授等在会上作了大会报告。会议论文集《Proceedings of the Conference of Global Chinese Scholars on Hydrodynamics》由朱德祥、周连第、杨显成主编，上海大学出版社出版。在该论文集上发表的87篇论文已全部被国际三大著名检索机构ISTP、EI和SCI收录：(1) 被ISTP（新称CPCI-S）收录：以《Proceedings of the Conference of Global Chinese Scholars on Hydrodynamics》的名义，2007年3月；(2) 被EI收录，以《Journal of Hydrodynamics》Volume 18, Issue 3, Supplement 1, July 2006，http://www.science direct.com/science/journal /10016058/18/3/supp/s.名义在Science Direct出版，2007年5月；(3) 被SCI收录，名义同(2)，第54条记录到144条，2012年4月。
第七届周培源优秀水动力学论文奖评选工作于2006年1月1日开始启动。按“周培源优秀水动力学论文奖实施办法”分报名申请、评估、初选、复评、审批五个阶段进行。评选结果如下：二等奖(1)：李玉成，等：局部开孔沉箱结构在斜向波作用下的受力分析，《水动力学研究与进展》A辑，2003, 18(5): 553-563；二等奖(2): 卢东强：自由表面与粘性尾迹的相互作用，《应用数学与力学》，2004, 25(6): 591-598；三等奖：施红辉，等：Study of Fluid Mechanics of Hypervelocity Liquid Jets, 《Journal of Hydrodynamics》, Ser. B, 2003, 15(6): 25-31。
第七届国际水动力学学术会议（ICHD 2006）于2006年在意大利举办。
从2006年开始，全球最具影响力的出版集团Elsevier在全球发行本刊。Elsevier的数据库Scopus和Science Direct全文收录本刊所载论文。
2006年上海市工商行政管理局批准设立上海《水动力学研究与进展》杂志社为独立核算、独立法人单位。法人代表是主编朱德祥。
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